arcanis/moldyn
1
0
Fork 0
mirror of https://github.com/arcan1s/moldyn.git synced 2025-07-22 18:19:58 +00:00
Code Issues Projects Releases Wiki Activity
Files
e64c3106933c45d847525e58a9f9e07e152e630d
moldyn/mathmech/mathmech/resources/translations/rus.ts
arcan1s e64c310693 fix building
2014-01-26 04:39:33 +04:00

2243 lines
278 KiB
XML
Raw Blame History

This file contains ambiguous Unicode characters

This file contains Unicode characters that might be confused with other characters. If you think that this is intentional, you can safely ignore this warning. Use the Escape button to reveal them.

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<!DOCTYPE TS>
<TS version="2.0" language="ru_RU">
<context>
<name>AboutWindow</name>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aboutwindow.h" line="78"/>
<source>About</source>
<translation>О программе</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aboutwindow.h" line="79"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Mathematical Molecular Mechanics&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;-qt-paragraph-type:empty; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Version:&lt;/span&gt; 1.0.0&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;License:&lt;/span&gt; GPL&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;-qt-paragraph-type:empty; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Author:&lt;/span&gt; Evgeniy Alekseev&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;E-mail:&lt;/span&gt; esalexeev@gmail.com&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;-qt-paragraph-type:empty; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Graphical user interface for &amp;quot;mathmech&amp;quot; program pack.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Mathematical Molecular Mechanics&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;-qt-paragraph-type:empty; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Версия:&lt;/span&gt; 1.2.0&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Лицензия:&lt;/span&gt; GPL&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;-qt-paragraph-type:empty; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;Автор:&lt;/span&gt; Evgeniy Alekseev&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;E-mail:&lt;/span&gt; esalexeev@gmail.com&lt;/p&gt;
&lt;p style=&quot;-qt-paragraph-type:empty; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Графический интерфейс для программного пакета &amp;quot;mathmech&amp;quot;.&lt;/p&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aboutwindow.h" line="94"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aboutwindow.h" line="96"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>AgglWindow</name>
<message>
<location filename="../../src/agglwindow.cpp" line="37"/>
<source>Select file</source>
<translation>Выбор файла</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/agglwindow.cpp" line="39"/>
<source>&apos;statgen&apos; output files (*.dat);;All files (*.*)</source>
<translation>Файлы &apos;statgen&apos; (*.dat);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/agglwindow.cpp" line="137"/>
<source>Save file as...</source>
<translation>Сохранить файл как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/agglwindow.cpp" line="139"/>
<source>Agglomerate files (*.agl);;All files (*.*)</source>
<translation>Файл с агломератом (*.agl);Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="198"/>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="215"/>
<source>Agglomerate</source>
<translation>Агломерат</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="199"/>
<source>Input file</source>
<translation>Входной файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="201"/>
<source>Path to input file</source>
<translation>Путь ко входному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="203"/>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="221"/>
<source>Browse</source>
<translation>Обзор</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="205"/>
<source>Read selected file</source>
<translation>Прочитать выбранный файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="207"/>
<source>Select</source>
<translation>Выбор</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="209"/>
<source>File name</source>
<translation>Имя файла</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="212"/>
<source>List of agglomerates</source>
<translation>Список агломератов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="217"/>
<source>Output file</source>
<translation>Выходной файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="219"/>
<source>Path to output file</source>
<translation>Путь к выходному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="223"/>
<source>Clear window</source>
<translation>Очистить окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="225"/>
<source>Clear</source>
<translation>Очистить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="227"/>
<source>Create file</source>
<translation>Создать файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="229"/>
<source>Create</source>
<translation>Создать</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="231"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_agglwindow.h" line="233"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>AglAll</name>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="82"/>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="83"/>
<source>Processing &apos;agl&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;agl&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="207"/>
<source>Done</source>
<translation>Готово</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>AglAllWindow</name>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="44"/>
<source>Select work directory</source>
<translation>Выбор рабочей директории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="54"/>
<source>Select trajectory file</source>
<translation>Выбор файла траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="56"/>
<source>&apos;statgen&apos; output files (*.dat);;All files (*.*)</source>
<translation>Файлы &apos;statgen&apos; (*.dat);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="65"/>
<source>Save file as...</source>
<translation>Сохранить файл как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/aglallwindow.cpp" line="67"/>
<source>PDB files (*.pdb);;All files (*.*)</source>
<translation>PDB файлы (*.pdb);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="241"/>
<source>agl_all</source>
<translation>agl_all</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="242"/>
<source>Work directory</source>
<translation>Рабочая директория</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="244"/>
<source>Path to work directory</source>
<translation>Путь к рабочей директории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="246"/>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="251"/>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="256"/>
<source>Browse</source>
<translation>Обзор</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="247"/>
<source>Input file</source>
<translation>Входной файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="249"/>
<source>Path to input file</source>
<translation>Путь ко входному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="252"/>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="254"/>
<source>Mask of output files</source>
<translation>Маска файлов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="257"/>
<source>File</source>
<translation>Файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="259"/>
<source>Number of file. &apos;0&apos; is all files</source>
<translation>Номер файла. &apos;0&apos; - все файлы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="261"/>
<source>Number of molecules</source>
<translation>Число молекул</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="263"/>
<source>Number of molecules in agglomerates. &apos;0&apos; is all agglomerates</source>
<translation>Число молекул в агломерате. &apos;0&apos; - все агломераты</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="266"/>
<source>Clear window</source>
<translation>Очистить окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="268"/>
<source>Clear</source>
<translation>Очистить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="270"/>
<source>Start analysis</source>
<translation>Старт анализ</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="272"/>
<source>Start</source>
<translation>Старт</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="274"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_aglallwindow.h" line="276"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>AtomTypesWindow</name>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="244"/>
<source>Atom types</source>
<translation>Типы атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="245"/>
<source>Output file</source>
<translation>Выходной файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="247"/>
<source>Path to output file</source>
<translation>Путь к выходному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="249"/>
<source>Browse</source>
<translation>Обзор</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="250"/>
<source>Molecule</source>
<translation>Молекула</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="253"/>
<source>1</source>
<translation>1</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/atomtypeswindow.cpp" line="87"/>
<location filename="../../src/atomtypeswindow.cpp" line="100"/>
<location filename="../../src/atomtypeswindow.cpp" line="103"/>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="254"/>
<source>Add new molecule</source>
<translation>Добавить новую молекулу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="257"/>
<source>Number of molecule</source>
<translation>Номер молекулы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="259"/>
<source>Number of molecules</source>
<translation>Число молекул</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="261"/>
<source>Number of selected molecules</source>
<translation>Число выбранных молекул</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="263"/>
<source>Char atom type</source>
<translation>Символьный тип</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="265"/>
<source>Character atop type</source>
<translation>Символьный тип атома</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="267"/>
<source>Int atom type</source>
<translation>Численный тип</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="269"/>
<source>Numerical atom type</source>
<translation>Численный тип атома</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="272"/>
<source>Add atom</source>
<translation>Добавить атом</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="274"/>
<source>Add</source>
<translation>Добавить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="276"/>
<source>Added atoms</source>
<translation>Добавленные атомы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="279"/>
<source>Remove selected atom</source>
<translation>Удалить выбранный атом</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="281"/>
<source>Remove</source>
<translation>Удалить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="283"/>
<source>Clear window</source>
<translation>Очистить окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="285"/>
<source>Clear</source>
<translation>Очистить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="287"/>
<source>Create file</source>
<translation>Создать файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="289"/>
<source>Create</source>
<translation>Создать</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="291"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_atomtypeswindow.h" line="293"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/atomtypeswindow.cpp" line="42"/>
<source>Save file as...</source>
<translation>Сохранить файл как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/atomtypeswindow.cpp" line="44"/>
<source>Atom types files (*.types);;All files (*.*)</source>
<translation>Файл типов атомов (*.types);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>ErrorWindow</name>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="22"/>
<source>Work directory does not exists</source>
<translation>Рабочая директория не существует</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="25"/>
<source>Input file is not set</source>
<translation>Входной файл не задан</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="28"/>
<source>Atoms in plane must be different</source>
<translation>Атомы, образующие плоскость, должны быть различными</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="31"/>
<source>Atom types file is not set</source>
<translation>Типы атомов не заданы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="34"/>
<source>Output file is not set</source>
<translation>Выходной файл не задан</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="37"/>
<source>Atom type must contain 2 characters</source>
<translation>Тип атома должен содержать 2 символа</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="40"/>
<source>Log file is not set</source>
<translation>Лог файл не задан</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="43"/>
<source>Component is not found</source>
<translation>Компонент не найден</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="46"/>
<source>Atom types is not set</source>
<translation>Тип атома не задан</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="49"/>
<source>Something wrong</source>
<translation>Что то не так</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="52"/>
<source>Interactions are not set</source>
<translation>Взаимодействия не заданы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="55"/>
<source>Invalid file type</source>
<translation>Неправильный тип файла</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="58"/>
<source>Interaction step is not set</source>
<translation>Шаг взаимодействия не задан</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/errorwindow.cpp" line="61"/>
<source>Unknown error</source>
<translation>Неизвестная ошибка</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_errorwindow.h" line="99"/>
<source>Error</source>
<translation>Ошибка</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_errorwindow.h" line="100"/>
<source>Error text</source>
<translation>Текст ошибки</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_errorwindow.h" line="101"/>
<source>Ok</source>
<translation>Ok</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>HelpWindow</name>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="180"/>
<source>Help</source>
<translation>Справка</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="182"/>
<source>Help about trj</source>
<translation>Справка по trj</translation>
</message>
<message>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;trj&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that generates trajectory files in special format from input trajectory.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_trj -i FILE -t TYPE -s NUMBER -a FILE -o MASK [ -tt NUMBER ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-t TYPE – trajectory type. Supported formats: gmx, puma&lt;br /&gt;-s NUMBER – number of trajectory steps&lt;br /&gt;-a FILE – file with atom types&lt;br /&gt;-o MASK – mask of output trajectory files&lt;br /&gt;-tt NUMBER – maximum number of different atom types. Default is 1024&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory files (*.[0-9])&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Number of atoms is shown in the title.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Trajectory snapshot (enumeration of all atoms in system). Format&lt;br /&gt;00001 СА 1234.000000 1234.000000 1234.000000 01 0001&lt;br /&gt;The sequence number of an atom (5 characters), space, character atom type (2 characters), 2 spaces, X coordinate (11 characters, 6 decimal part), Y coordinate (11 characters, 6 decimal part), Z coordinate (11 characters, 6 decimal part), 4 spaces, numerical atom type (2 characters), space, number of molecule (4 characters).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Atom types file (*.types)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The number of different molecules (NUMTYPES=1) is shown in the title.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The enumeration of molecules block. Variables are the number of molecules (NUMMOL=1), the number of atoms (NUMAT=1).&lt;br /&gt;The enumeration of atoms block. Format&lt;br /&gt;CA=1&lt;br /&gt;Character atom type (2 characters), equal sign, numerical atom type&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Step by step reading of source files, print results to the specified output file&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select Menu -&amp;gt; File creator -&amp;gt; Atom types file&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set atom types. To add a new molecule you need select &amp;quot;Add new molecule&amp;quot; from the drop down list. To change the number of molecules you need change the corresponding numeric value. To add a new atom you need enter 2 character to the special field, set numerical atom type and press &amp;quot;Add&amp;quot;. After this the atom will appear in the special window. To remove an atom you need select the desired atom in the special window and press &amp;quot;Remove&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Create the atom types file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Generate trajectory&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select the trajectory type from the drop down list, set the number of trajectory steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the atom types file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the mask of output files.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the maximum number of different atom types and the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation type="obsolete">&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;trj&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации специальных траекторных файлов из указанных исходных.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_trj -i ФАЙЛ -t ТИП -s ЧИСЛО -a ФАЙЛ -o МАСКА [ -tt ЧИСЛО ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный траекторный файл&lt;br /&gt;-t ТИП – тип траектории. Поддерживаемые форматы: gmx, puma&lt;br /&gt;-s ЧИСЛО – число шагов траектории&lt;br /&gt;-a ФАЙЛ – файл с указанием типов атомов&lt;br /&gt;-o МАСКА – маска получаемых траекторных файлов&lt;br /&gt;-tt ЧИСЛО – максимальное число различных типов атомов. По умолчанию 1024.&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файлы траектории (*.[0-9])&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается число атомов (7 символов).&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Снимок траектории (перечисление всех атомов). Формат&lt;br /&gt;00001 СА 1234.000000 1234.000000 1234.000000 01 0001&lt;br /&gt;Порядковый номер атома (5 символов), пробел, символьный тип атома (2 символа), 2 пробела, координата X (11 символов, 6 десятичной части), координата Y (11 символов, 6 десятичной части), координата Z (11 символов, 6 десятичной части), 4 пробела, численный тип атома (2 символа), пробел, номер молекулы (4 символа).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл с указанием типов атомов (*.types)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается число молекул (NUMTYPES=1).&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок перечисления молекул. Переменные число молекул (NUMMOL=1), число атомов (NUMAT=1).&lt;br /&gt;Блок перечисления атомов в молекуле. Формат&lt;br /&gt;CA=1&lt;br /&gt;Символьный тип атома (2 символа), символ равенства, численный тип атома.&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Пошаговое чтение исходных файлов и вывод шагов в указанные файлы.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Выбрать Меню -&amp;gt; Создание файлов -&amp;gt; Файл типов атомов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Заполнить типы атомов. Для добавления новой молекулы выбрать из выпадающего списка &amp;quot;Добавить новую молекулу&amp;quot;. Для изменения числа молекул изменить соответствующее числовое значение. Для добавления нового атома необходимо ввести 2 символа в специальное поле, указать численный тип атома и нажать &amp;quot;Добавить&amp;quot; – после этого атом появится в специальном окошке. Для удаления атома необходимо выделить нужный атом в окошке и нажать &amp;quot;Удалить&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Создать файл типов атомов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Создать траекторию&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать исходный траекторный файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Выбрать тип траектории из выпадающего списка, указать число шагов траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать созданный ранее файл типов атомов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать маску генерируемых файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать максимальное число различных типов атомов и файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="220"/>
<source>trj</source>
<translation>trj</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="222"/>
<source>Help about statgen</source>
<translation>Справка по statgen</translation>
</message>
<message>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;statgen&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that analyzes molecular dynamic trajectories using topological analysis.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_statgen -i MASK -s NUMBER,NUMBER -c X,Y,Z -a FORMAT -r FORMAT -o FILE [ -g NUMBER ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i MASK – mask of trajectory files&lt;br /&gt;-s NUMBER,NUMBER – first and last trajectory steps&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-a FORMAT – numerical atom types. Maximum number of different atom types is 4. Types are comma separated&lt;br /&gt;-r FORMAT – criteria, A. This flag can be used multiple times. Different interactions are comma separated. Type interaction, colon character, criterion. For example &amp;quot;0-0:2.4,0-1:3.0&amp;quot; means set 0-0 interaction as &amp;lt;2.4 А and 0-1 interaction as &amp;lt;3.0 A&lt;br /&gt;-o FILE – output file&lt;br /&gt;-g NUMBER – chech graph isomorphism. NUMBER is a maximum depth for search cycles (&amp;gt;= 3)&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Output file (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Program name and version are shown in the title. For example, &amp;quot;statgen ::: V.1.2.0&amp;quot;. Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The configuration block &amp;quot;CONFIGURATION ... END&amp;quot;. Print log (LOG=1), do not print messages to STDOUT (QUIET=1), mask of trajectory files (MASK=mask), first (FIRST=1) and last (LAST=1) trajectory steps, sell size (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), atom types (ATOMS=1,2,3,4), interactions (INTERACTION=format), maximum depth for check cycle number (DEPTH=0, 0 - do not check graph isomorphism). Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The enumeration of statistics on individual files.&lt;br /&gt;File name (FILE=mask.001), the statistic block for file &amp;quot;STATISTIC ... -----------------&amp;quot;. Table layout (2 rows) follows after specifying the block. The table format&lt;br /&gt; 0000001 0000001 &lt;br /&gt;Space, agglomerate size (7 characters), space, number of agglomerates of this size in the file (7 characters).&lt;br /&gt;The enumeration of agglomerates in the file. Agglomerate title (AGL=2=1.3.4.) (1 – number of molecules in the agglomerate, 1.3.4. – agglomerate class, if verification of isomorphism is specified). The enumeration of molecules in the agglomerate. (0000001=2,3,4,5,) (1 – number of molecule (7 characters), equal sign, the enumeration of connected molecules separated by commas).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The summary statistic block «SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------». Table layout (2 rows) follows after specifying the block. The table format&lt;br /&gt; 0000001 0000002 000003.00 004.00000 0005.00000&lt;br /&gt;Space, agglomerate size (7 characters), space, total number of agglomerates of this size (7 characters), space, average concentration of agglomerates of this size (9 characters, 2 decimal part), space, probability of finding molecules in agglomerates of this size (9 characters, 5 decimal part), space, probability of finding molecules in agglomerates of this size multiplied by the size (10 characters, 5 decimal part).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Summary statistic of agglomerates on classes (if verification of isomorphism is specified). The proportion of linear (LINEAR=0.10000) and cyclic (CYCLE=0.10000) agglomerates, blank line, the proportion of not branched (NOT BRANCHED=0.10000) and branched (BRANCHED=0.10000) agglomerates, blank line, the proportion of found cycles of the specified size (CYCLE_03=0.10000).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Step by step reading of source files, settings values of variables.&lt;br /&gt;Search for interactions that satisfy the specified criteria.&lt;br /&gt;The analysis of all connections and specifying of the two molecules that connected, if the conditions are satisfied at least one of these criteria.&lt;br /&gt;Adding molecules to agglomerates according to the obtained connectivity matrix.&lt;br /&gt;Print agglomerates to the file, adding the summary statistics.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the summary statistic to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Agglomeration&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the mask of trajectory files.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the first and the last trajectory steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size, A.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set needed atoms.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set interactions. Select type of interaction from the drop down list, change its criterion and press &amp;quot;Save&amp;quot;. Press &amp;quot;Add&amp;quot; after ending of edition. After this the interaction will appear in the special window. To remove an interaction you need select the desired interaction in the special window and press &amp;quot;Remove&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the maximum depth for search cycles, log file and graph generate if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;For the variation of geometric criteria you need specify the criteria step changes and the number of steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation type="obsolete">&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;statgen&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для анализа снимков молекулярно-динамических траекторий – выделяет молекулы в агломераты согласно указанному геометрическому критерию.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_statgen -i МАСКА -s ЧИСЛО,ЧИСЛО -c X,Y,Z -a ФОРМАТ -r ФОРМАТ -o ФАЙЛ [ -g ЧИСЛО ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i МАСКА – маска снимков траектории&lt;br /&gt;-s ЧИСЛО,ЧИСЛО – первый и последний шаги траектории&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-a ФОРМАТ – численные типы атомов. Максимальное число различных атомов 4. Типы атомов перечисляются через запятую&lt;br /&gt;-r ФОРМАТ – критерии, А. Этот флаг может быть указан несколько раз. Различные взаимодействия перечисляются через запятую. Указывается тип взаимодействия, двоеточие, критерий. Например, &amp;quot;0-0:2.4,0-1:3.0&amp;quot; означает указание 0-0 взаимодействия &amp;lt;2.4 А и 0-1 &amp;lt;3.0 А.&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый файл&lt;br /&gt;-g NUMBER – проверять изоморфизм графов. ЧИСЛО – максимальная глубина для проверки числа циклов (&amp;gt;= 3)&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Генерируемый файл (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается название программы и ее версия, например &amp;quot;statgen ::: V.1.2.0&amp;quot;. Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок конфигурации &amp;quot;CONFIGURATION … END&amp;quot;. Печать лога (LOG=1), не выводить сообщения в STDOUT (QUIET=1), маска файлов (MASK=mask), первый (FIRST=1) и последний (LAST=1) шаги траектории, размер ячейки (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), типы атомов (ATOMS=1,2,3,4), взаимодействия (INTERACTION=формат), максимальная глубина для проверки числа циклов (DEPTH=0, 0 – не проверять изоморфизм). Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перечисление статистики по файлам.&lt;br /&gt;Имя файла (FILE=mask.001), блок статистики по файлу &amp;quot;STATISTIC … -----------------&amp;quot;. После указания блока следует разметка таблицы (2 строки). Формат таблицы&lt;br /&gt; 0000001 0000001 &lt;br /&gt;Пробел, размер агломерата (7 символов), пробел, число агломератов данной стехиометрии в файле (7 символов).&lt;br /&gt;Перечисление агломератов, найденных в данном файле. Заголовок агломерата (AGL=2=1.3.4.) (1 – число молекул в агломерате, 1.3.4. – класс агломерата, если указана проверка изоморфизма). Перечисление молекул в агломерате (0000001=2,3,4,5,) (1 – номер молекулы (7 символов), знак равенства, перечисление связанных молекул через запятую).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Общая статистика &amp;quot;.SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------&amp;quot;..После указания блока следует разметка таблицы (2 строки). Формат таблицы&lt;br /&gt; 0000001 0000002 000003.00 004.00000 0005.00000&lt;br /&gt;Пробел, размер агломерата (7 символов), пробел, общее число агломератов данной стехиометрии (7 символов), пробел, средняя концентрация агломератов данной стехиометрии (9 символов, 2 десятичной части), пробел, вероятность нахождения молекулы в агломерате данной стехиометрии (9 символов, 5 десятичной части), пробел, вероятность нахождения молекулы в агломерате данной стехиометрии, умноженная на число молекул в агломерате (10 символов, 5 десятичной части).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Общая статистика агломератов по классам (если указана проверка изоморфизма). Доля линейных (LINEAR=0.10000) и циклических (CYCLE=0.10000) агломератов, пропуск строки, доля неразветвленных (NOT BRANCHED=0.10000) и разветвленных (BRANCHED=0.10000) агломератов, пропуск строки, доля найденных циклов указанного размера (CYCLE_03=0.10000).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Пошаговое чтение исходных файлов, установка переменных.&lt;br /&gt;Поиск взаимодействий, удовлетворяющих указанным критериям.&lt;br /&gt;Анализ всех связей и указание связи двух молекул, если удовлетворяется условия хотя бы одного из указанных критериев.&lt;br /&gt;Добавление молекул в агломераты согласно полученной матрице связанности.&lt;br /&gt;Печать агломератов в файл, дополнение общей статистики.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать общей статистики в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Агломерация&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать маску траекторных файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать первый и последний шаги траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать искомые атомы.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать взаимодействия. Из выпадающего списка выбрать тип взаимодействия, изменить при его критерий (А) и нажать &amp;quot;Сохранить&amp;quot;. После завершения редактирования нажать &amp;quot;Добавить&amp;quot; – после этого взаимодействие появится в специальном окошке.. Для удаления взаимодействия необходимо выделить нужное взаимодействие в окошке и нажать &amp;quot;Удалить&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать максимальную глубину для проверки числа циклов в агломератах, файл лога и генерацию графика.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Для вариации геометрических критериев необходимо указать шаг изменения критериев и число шагов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="262"/>
<source>statgen</source>
<translation>statgen</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="264"/>
<source>Help about envir</source>
<translation>Справка по envir</translation>
</message>
<message>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;envir&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that searchs environment for chosen molecule by geometric criterion.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_envir -i FILE -c X,Y,Z -o FILE [ -n NUMBER ] [ -r NUMBER ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-o FILE – output PDB file&lt;br /&gt;-n NUMBER – number of molecule for search. Default is 1&lt;br /&gt;-r NUMBER – radius of environment. Default is 6.0&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory file (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading of source file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Search for the environment.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the environment to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Environment&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output PDB file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the number of molecule for search and the radius of environment.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation type="obsolete">&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;envir&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации PDB файла указанной молекулы с окружением указанного радиуса.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_envir -i ФАЙЛ -c X,Y,Z -o ФАЙЛ [ -n ЧИСЛО ] [ -r ЧИСЛО ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный файл с координатами&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый PDB файл с координатами&lt;br /&gt;-n ЧИСЛО – номер молекулы для поиска окружения. По умолчанию 1&lt;br /&gt;-r ЧИСЛО – радиус окружения, А. По умолчанию 6.0&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл траектории (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение исходного файла.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Поиск окружения.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать окружения в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Окружение&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать исходный файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый PDB файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать молекулу для поиска окружения и радиус окружения в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="293"/>
<source>envir</source>
<translation>envir</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="295"/>
<source>Help about radf</source>
<translation>Справка по radf</translation>
</message>
<message>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;radf&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that calculates radial distribution function (RDF) or radial-angles distribution function (RADF)&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_radf -i MASK -s NUMBER,NUMBER -c X,Y,Z -at FORMAT -o FILE [ -r NUMBER,NUMBER ] [ -rs NUMBER ] [ -a NUMBER,NUMBER ] [ -as NUMBER ] [ -m ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i MASK – mask of trajectory files&lt;br /&gt;-s NUMBER,NUMBER – first and last trajectory steps&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-at FORMAT – numerical atom types between which the function is constructed. Format is &amp;quot;1-2&amp;quot; or &amp;quot;1,2,3-4,5,6&amp;quot; (automatically enable calculation of radial distribution function between centers of mass)&lt;br /&gt;-o FILE – output file&lt;br /&gt;-r NUMBER,NUMBER – radial criteria. Default is 2.0 and 15.0&lt;br /&gt;-rs NUMBER – radius change step. Default is 0.2&lt;br /&gt;-a NUMBER,NUMBER – angular criteria. Default is 0.0 and 90.0&lt;br /&gt;-as NUMBER – angle change step. This option will enable calculation of radial-angles distribution function&lt;br /&gt;-as – enable matrix output&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Output file (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Program name and version are shown in the title. For example, &amp;quot;radf ::: V.1.2.0&amp;quot;. Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The configuration block &amp;quot;CONFIGURATION ... END&amp;quot;. Print log (LOG=1), do not print messages to STDOUT (QUIET=1), matrix output (MATRIX=1), mask of trajectory files (MASK=mask), first (FIRST=1) and last (LAST=1) trajectory steps, sell size (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), mode (MODE=0) (0 – radial distribution function, 1 – radial distribution function between centers of mass, 2 – radial-angles distribution function), radial criteria (R_MIN=0.100) (R_MAX=0.100) (R_STEP=0.100), angular criteria for radial-angles distribution function (ANG_MIN=0.10) (ANG_MAX=0.10) (ANG_STEP=0.10), atom types (ATOM=1-2) or (ATOM=1,2,3-4,5,6). Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The results block «SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------». Table layout (2 rows) follows after specifying the block if matrix output disables.&lt;br /&gt;The table format for radial distribution function (matrix output disables)&lt;br /&gt; 0001.0000 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, sphere volume (10 characters, 4 decimal part), space, number of molecules in this radius (9 characters), space, radial distribution function (9 characters, 6 decimal part).&lt;br /&gt;The table format for radial distribution function (matrix output enables)&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, radial distribution function (9 characters, 6 decimal part).&lt;br /&gt;The table format for radial-angles distribution function (matrix output disables)&lt;br /&gt; 0001.0000 000005.00 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, segment angle (9 characters, 2 decimal part), segment volume (10 characters, 4 decimal part), space, number of molecules in this segment (9 characters), space, radial-angles distribution function (9 characters, 6 decimal part).&lt;br /&gt;The table format for radial-angles distribution function (matrix output enables). Segment angle (9 characters, 2 decimal part) is shown in the title&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000 ...&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, radial-angles distribution function (9 characters, 6 decimal part) separated by spaces.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;End of the table&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Step by step reading of source files, settings values of variables.&lt;br /&gt;Calculating of the number of pairs of molecules in various relative configurations.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the result to the file.&lt;br /&gt;Radial distribution function calculated by:&lt;br /&gt;RDF(r) = (1 / norm) * sum(d(r_n-r), n),&lt;br /&gt;norm(r) = (4*PI*r^2*dr) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;where d(r_n-r) is the delta function, r is a shpere radius, n is a number of molecule, dr is the radius change step, ro is the number of molecules per volume unit, N is the number of molecules, N_step is a number of trajectory step.&lt;br /&gt;Radial-angles distribution function calculated by:&lt;br /&gt;RADF(r, fi) = (1 / norm) * sum(sum(d(r_n-r)*d(fi_n-fi), n), n),&lt;br /&gt;norm(r, fi) = (4*PI*r^2*sin(fi)*dr*dfi) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;where d(r_n-r) and d(fi_n-fi) are the delta functions, r is a shpere radius, fi is a segment angle, n is a number of molecule, dr is the radius change step, dfi is the angle change step, ro is the number of molecules per volume unit, N is the number of molecules, N_step is a number of trajectory step.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;RADF&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the mask of trajectory files.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the first and the last trajectory steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size, A.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set needed atoms.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set radial criteria. Set angular criteria if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the matrix output, log file and graph generate if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation type="obsolete">&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;radf&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для расчета функций радиального (ФРР) и радиально-углового распределения (ФРУР).&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_radf -i МАСКА -s ЧИСЛО,ЧИСЛО -c X,Y,Z -at ФОРМАТ -o ФАЙЛ [ -r ЧИСЛО,ЧИСЛО ] [ -rs ЧИСЛО ] [ -a ЧИСЛО,ЧИСЛО ] [ -as ЧИСЛО ] [ -m ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i МАСКА – маска снимков траектории&lt;br /&gt;-s ЧИСЛО,ЧИСЛО – первый и последний шаги траектории&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-at ФОРМАТ – численные типы атомов между которыми строится функция. Формат &amp;quot;1-2&amp;quot; или &amp;quot;1,2,3,-4,5,6&amp;quot; (автоматически включит расчет функции радиального распределения между центрами масс).&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый файл&lt;br /&gt;-r ЧИСЛО,ЧИСЛО – минимальный и максимальный радиус, А. По умолчанию 2.0 и 15.0&lt;br /&gt;-rs ЧИСЛО – шаг изменения радиуса, А. По умолчанию 0.2&lt;br /&gt;-a ЧИСЛО,ЧИСЛО – минимальный и максимальный угол, град. По умолчанию 0.0 и 90.0&lt;br /&gt;-as ЧИСЛО – шаг изменения угла, град. Эта опция включит расчет функции радиально-углового распределения&lt;br /&gt;-m – печать в виде матрицы&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Генерируемый файл (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается название программы и ее версия, например &amp;quot;radf ::: V.1.2.0&amp;quot;. Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок конфигурации &amp;quot;CONFIGURATION … END&amp;quot;. Печать лога (LOG=1), не выводить сообщения в STDOUT (QUIET=1), матричный вывод (MATRIX=1), файлов (MASK=mask), первый (FIRST=1) и последний (LAST=1) шаги траектории, размер ячейки (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), тип расчета (MODE=0) (0 – для функции радиального распределения, 1 – для функции радиального распределения для центров масс, 2 – для функции радиально-углового распределения), радиальные критерии (R_MIN=0.100) (R_MAX=0.100) (R_STEP=0.100), угловые критерии для функции радиально-углового распределения (ANG_MIN=0.10) (ANG_MAX=0.10) (ANG_STEP=0.10), типы атомов (ATOM=1-2) или (ATOM=1,2,3-4,5,6). Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок результатов &amp;quot;SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------&amp;quot;. После указания блока, если отключен матричный вывод, следует разметка таблицы (2 строки).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиального распределения (матричный вывод отключен)&lt;br /&gt; 0001.0000 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, объем сферы (10 символов, 4 десятичной части), пробел, число молекул в данной сфере (9 символов), функция радиального распределения (9 символов, 6 десятичной части).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиального распределения (матричный вывод включен)&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, функция радиального распределения (9 символов, 6 десятичной части).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиально-углового распределения (матричный вывод отключен)&lt;br /&gt; 0001.0000 000005.00 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, угол (9 символов, 2 десятичной части), пробел, объем сегмента (10 символов, 4 десятичной части), пробел, число молекул в данном сегменте (9 символов), функция радиально-углового распределения (9 символов, 6 десятичной части).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиально-углового распределения (матричный вывод включен). В заголовке указывается угол (9 символов, 2 десятичной части)&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000 …&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, функция радиально-углового распределения (9 символов, 6 десятичной части) через пробелы, соответствующие данному углу.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Конец таблицы.&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложенияn&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Пошаговое чтение исходных файлов. Установка переменных.&lt;br /&gt;Расчет количества пар молекул, находящихся в различных взаимных конфигурациях.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать результата в файл.&lt;br /&gt;Функция радиального распределения рассчитывается по формуле:&lt;br /&gt;RDF(r) = (1 / norm) * sum(d(r_n-r), n),&lt;br /&gt;norm(r) = (4*PI*r^2*dr) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;где d(r_n-r) – дельта-функция, r – радиус сферы, n – номер молекулы, dr – шаг изменения радиуса, ro – число молекул в единице объема, N – число молекул, N_step – число шагов траектории.&lt;br /&gt;Функция радиально-углового распределения рассчитывается по формуле:&lt;br /&gt;RADF(r, fi) = (1 / norm) * sum(sum(d(r_n-r)*d(fi_n-fi), n), n),&lt;br /&gt;norm(r, fi) = (4*PI*r^2*sin(fi)*dr*dfi) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;где d(r_n-r) и d(fi_n-fi) – дельта-функции, r – радиус сферы, fi – угол, n – номер молекулы, dr – шаг изменения радиуса, dfi – шаг изменения угла, ro – число молекул в единице объема, N – число молекул, N_step – число шагов траектории.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;ФРУР&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать маску траекторных файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать первый и последний шаги траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать искомые атомы.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать радиальные параметры функции в А. При необходимости указать угловые параметры функции в градусах.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать печать в виде матрицы, файл лога и генерацию графика.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="333"/>
<source>radf</source>
<translation>radf</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="335"/>
<source>Help about agl</source>
<translation>Справка по agl</translation>
</message>
<message>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;agl&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that creates PDB file with chosen agglomerate.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_agl -a FILE -i FILE -c X,Y,Z -o FILE [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-a FILE – input file with agglomerate&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-o FILE – output PDB file&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Agglomerate file (*.agl)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Agglomerate title (AGL=2=1.3.4.) (1 – number of molecules in the agglomerate, 1.3.4. – agglomerate class, if verification of isomorphism is specified).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The enumeration of molecules in the agglomerate. (0000001=2,3,4,5,) (1 – number of molecule (7 characters), equal sign, the enumeration of connected molecules separated by commas).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory file (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading of source file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Search for the best configuration.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the result to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select Menu -&amp;gt; File creator -&amp;gt; Agglomerate file&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the file generated by statgen. Push &amp;quot;Select&amp;quot;&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select the trajectory file from the drop down list. Select the agglomerate.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file. Create file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Generate PDB&amp;quot;. Select &amp;quot;From agglomerate&amp;quot; from the drop down list.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the agglomerate file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output PDB file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation type="obsolete">&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;agl&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации PDB файлов с агломератами.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_agl -a ФАЙЛ -i ФАЙЛ -c X,Y,Z -o ФАЙЛ [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-a ФАЙЛ – исходный файл с агломератом&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный файл с координатами&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый PDB файл с координатами&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл с агломератом (*.agl)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Заголовок агломерата (AGL=2=1.3.4.) (1 – число молекул в агломерате, 1.3.4. – класс агломерата, если указана проверка изоморфизма).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перечисление молекул в агломерате (0000001=2,3,4,5,) (1 – номер молекулы (7 символов), знак равенства, перечисление связанных молекул через запятую).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл траектории (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение исходных файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Поиск оптимальной конфигурации.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать результата в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Меню -&amp;gt; Создание файлов -&amp;gt; Файл с агломератом.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать файл, сгенерированный приложением statgen. Нажать &amp;quot;Выбор&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Выбрать траекторный снимок в выпадающем списке. Выбрать агломерат.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать выходной файл. Создать файл с агломератом.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;5. Перейти во вкладку &amp;quot;Создать PDB&amp;quot;. Из выпадающего списка выбрать &amp;quot;Из агломерата&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать файл траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать сгенерированный файл с агломератом.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый PDB файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message utf8="true">
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="184"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;trj&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that generates trajectory files in special format from input trajectory.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_trj -i FILE -t TYPE -s NUMBER -a FILE -o MASK [ -tt NUMBER ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-t TYPE – trajectory type. Supported formats: gmx, puma&lt;br /&gt;-s NUMBER – number of trajectory steps&lt;br /&gt;-a FILE – file with atom types&lt;br /&gt;-o MASK – mask of output trajectory files&lt;br /&gt;-tt NUMBER – maximum number of different atom types. Default is 1024&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory files (*.[0-9])&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Number of atoms is shown in the title.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Trajectory snapshot (enumeration of all atoms in system). Format&lt;br /&gt;00001 СА 1234.000000 1234.000000 1234.000000 01 0001&lt;br /&gt;The sequence number of an atom (5 characters), space, character atom type (2 characters), 2 spaces, X coordinate (11 characters, 6 decimal part), Y coordinate (11 characters, 6 decimal part), Z coordinate (11 characters, 6 decimal part), 4 spaces, numerical atom type (2 characters), space, number of molecule (4 characters).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Atom types file (*.types)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The number of different molecules (NUMTYPES=1) is shown in the title.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The molecules enumeration block. Variables are the number of molecules (NUMMOL=1), the number of atoms (NUMAT=1).&lt;br /&gt;The atoms enumeration block. Format&lt;br /&gt;CA=1&lt;br /&gt;Character atom type (2 characters), equal sign, numerical atom type.&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Step by step reading of source files, print results to the specified output file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select Menu -&amp;gt; File creator -&amp;gt; Atom types file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set atom types. To add a new molecule you need select &amp;quot;Add new molecule&amp;quot; from the drop down list. To change the number of molecules you need change the corresponding numeric value. To add a new atom you need enter 2 character to the special field, set numerical atom type and press &amp;quot;Add&amp;quot;. After this the atom will appear in the special window. To remove an atom you need select the desired atom in the special window and press &amp;quot;Remove&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Create the atom types file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Generate trajectory&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select the trajectory type from the drop down list, set the number of trajectory steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the atom types file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the mask of output files.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the maximum number of different atom types and the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;trj&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации специальных траекторных файлов из указанных исходных.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_trj -i ФАЙЛ -t ТИП -s ЧИСЛО -a ФАЙЛ -o МАСКА [ -tt ЧИСЛО ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный траекторный файл&lt;br /&gt;-t ТИП – тип траектории. Поддерживаемые форматы: gmx, puma&lt;br /&gt;-s ЧИСЛО – число шагов траектории&lt;br /&gt;-a ФАЙЛ – файл с указанием типов атомов&lt;br /&gt;-o МАСКА – маска получаемых траекторных файлов&lt;br /&gt;-tt ЧИСЛО – максимальное число различных типов атомов. По умолчанию 1024&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файлы траектории (*.[0-9])&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается число атомов (7 символов).&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Снимок траектории (перечисление всех атомов). Формат&lt;br /&gt;00001 СА 1234.000000 1234.000000 1234.000000 01 0001&lt;br /&gt;Порядковый номер атома (5 символов), пробел, символьный тип атома (2 символа), 2 пробела, координата X (11 символов, 6 десятичной части), координата Y (11 символов, 6 десятичной части), координата Z (11 символов, 6 десятичной части), 4 пробела, численный тип атома (2 символа), пробел, номер молекулы (4 символа).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл с указанием типов атомов (*.types)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается число молекул (NUMTYPES=1).&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок перечисления молекул. Переменные число молекул (NUMMOL=1), число атомов (NUMAT=1).&lt;br /&gt;Блок перечисления атомов в молекуле. Формат&lt;br /&gt;CA=1&lt;br /&gt;Символьный тип атома (2 символа), символ равенства, численный тип атома.&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Пошаговое чтение исходных файлов и вывод шагов в указанные файлы.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Выбрать Меню -&amp;gt; Создание файлов -&amp;gt; Файл типов атомов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Заполнить типы атомов. Для добавления новой молекулы выбрать из выпадающего списка &amp;quot;Добавить новую молекулу&amp;quot;. Для изменения числа молекул изменить соответствующее числовое значение. Для добавления нового атома необходимо ввести 2 символа в специальное поле, указать численный тип атома и нажать &amp;quot;Добавить&amp;quot; – после этого атом появится в специальном окошке. Для удаления атома необходимо выделить нужный атом в окошке и нажать &amp;quot;Удалить&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Создать файл типов атомов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Создать траекторию&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать исходный траекторный файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Выбрать тип траектории из выпадающего списка, указать число шагов траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать созданный ранее файл типов атомов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать маску генерируемых файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать максимальное число различных типов атомов и файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message utf8="true">
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="224"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;statgen&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that analyzes molecular dynamics trajectories using topological analysis.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_statgen -i MASK -s NUMBER,NUMBER -c X,Y,Z -a FORMAT -r FORMAT -o FILE [ -g NUMBER ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i MASK – mask of trajectory files&lt;br /&gt;-s NUMBER,NUMBER – first and last trajectory steps&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-a FORMAT – numerical atom types. Maximum number of different atom types is 4. Types are comma separated&lt;br /&gt;-r FORMAT – criteria, A. This flag can be used multiple times. Different interactions are comma separated. Type interaction, colon character, criterion. For example &amp;quot;0-0:2.4,0-1:3.0&amp;quot; means set 0-0 interaction as &amp;lt;2.4 А and 0-1 interaction as &amp;lt;3.0 A&lt;br /&gt;-o FILE – output file&lt;br /&gt;-g NUMBER – chech graph isomorphism. NUMBER is a maximum depth for search cycles (&amp;gt;= 3)&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Output file (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Program name and version are shown in the title. For example, &amp;quot;statgen ::: V.1.2.0&amp;quot;. Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The configuration block &amp;quot;CONFIGURATION ... END&amp;quot;. Print log (LOG=1), do not print messages to STDOUT (QUIET=1), mask of trajectory files (MASK=mask), first (FIRST=1) and last (LAST=1) trajectory steps, sell size (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), atom types (ATOMS=1,2,3,4), interactions (INTERACTION=format), maximum depth for check cycle number (DEPTH=0, 0 - do not check graph isomorphism). Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The enumeration of statistics on individual files.&lt;br /&gt;File name (FILE=mask.001), the statistic block for file &amp;quot;STATISTIC ... -----------------&amp;quot;. Table layout (2 rows) follows after specifying the block. The table format&lt;br /&gt; 0000001 0000001 &lt;br /&gt;Space, agglomerate size (7 characters), space, number of agglomerates of this size in the file (7 characters).&lt;br /&gt;The enumeration of agglomerates in the file. Agglomerate title (AGL=2=1.3.4.) (1 – number of molecules in the agglomerate, 1.3.4. – agglomerate class, if verification of isomorphism is specified). The enumeration of molecules in the agglomerate. (0000001=2,3,4,5,) (1 – number of molecule (7 characters), equal sign, the enumeration of connected molecules separated by commas).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The summary statistic block &amp;quot;SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------&amp;quot;. Table layout (2 rows) follows after specifying the block. The table format&lt;br /&gt; 0000001 0000002 000003.00 004.00000 0005.00000&lt;br /&gt;Space, agglomerate size (7 characters), space, total number of agglomerates of this size (7 characters), space, average concentration of agglomerates of this size (9 characters, 2 decimal part), space, probability of finding molecules in agglomerates of this size (9 characters, 5 decimal part), space, probability of finding molecules in agglomerates of this size multiplied by the size (10 characters, 5 decimal part).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Summary statistic of agglomerates on classes (if verification of isomorphism is specified). The proportion of linear (LINEAR=0.10000) and cyclic (CYCLE=0.10000) agglomerates, blank line, the proportion of not branched (NOT BRANCHED=0.10000) and branched (BRANCHED=0.10000) agglomerates, blank line, the proportion of found cycles of the specified size (CYCLE_03=0.10000).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Step by step reading of source files, settings values of variables.&lt;br /&gt;Search for interactions that satisfy the specified criteria.&lt;br /&gt;The analysis of all connections and specifying to the two molecules that connected, if the conditions are satisfied at least one of these criteria.&lt;br /&gt;Adding molecules to agglomerates according to the obtained connectivity matrix.&lt;br /&gt;Print agglomerates to the file, adding the summary statistics.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the summary statistic to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Agglomeration&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the mask of trajectory files.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the first and the last trajectory steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size, A.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set needed atoms.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set interactions. Select type of interaction from the drop down list, change its criterion and press &amp;quot;Save&amp;quot;. Press &amp;quot;Add&amp;quot; after ending of edition. After this the interaction will appear in the special window. To remove an interaction you need select the desired interaction in the special window and press &amp;quot;Remove&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the maximum depth for search cycles, the log file and the graph generate if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;For the variation of geometric criteria you need specify the criteria step changes and the number of steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;statgen&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для анализа снимков молекулярно-динамических траекторий – выделяет молекулы в агломераты согласно указанному геометрическому критерию.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_statgen -i МАСКА -s ЧИСЛО,ЧИСЛО -c X,Y,Z -a ФОРМАТ -r ФОРМАТ -o ФАЙЛ [ -g ЧИСЛО ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i МАСКА – маска снимков траектории&lt;br /&gt;-s ЧИСЛО,ЧИСЛО – первый и последний шаги траектории&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-a ФОРМАТ – численные типы атомов. Максимальное число различных атомов 4. Типы атомов перечисляются через запятую&lt;br /&gt;-r ФОРМАТ – критерии, А. Этот флаг может быть указан несколько раз. Различные взаимодействия перечисляются через запятую. Указывается тип взаимодействия, двоеточие, критерий. Например, &amp;quot;0-0:2.4,0-1:3.0&amp;quot; означает указание 0-0 взаимодействия &amp;lt;2.4 А и 0-1 &amp;lt;3.0 А.&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый файл&lt;br /&gt;-g NUMBER – проверять изоморфизм графов. ЧИСЛО – максимальная глубина для проверки числа циклов (&amp;gt;= 3)&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Генерируемый файл (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается название программы и ее версия, например &amp;quot;statgen ::: V.1.2.0&amp;quot;. Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок конфигурации &amp;quot;CONFIGURATION … END&amp;quot;. Печать лога (LOG=1), не выводить сообщения в STDOUT (QUIET=1), маска файлов (MASK=mask), первый (FIRST=1) и последний (LAST=1) шаги траектории, размер ячейки (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), типы атомов (ATOMS=1,2,3,4), взаимодействия (INTERACTION=формат), максимальная глубина для проверки числа циклов (DEPTH=0, 0 – не проверять изоморфизм). Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перечисление статистики по файлам.&lt;br /&gt;Имя файла (FILE=mask.001), блок статистики по файлу &amp;quot;STATISTIC … -----------------&amp;quot;. После указания блока следует разметка таблицы (2 строки). Формат таблицы&lt;br /&gt; 0000001 0000001 &lt;br /&gt;Пробел, размер агломерата (7 символов), пробел, число агломератов данной стехиометрии в файле (7 символов).&lt;br /&gt;Перечисление агломератов, найденных в данном файле. Заголовок агломерата (AGL=2=1.3.4.) (1 – число молекул в агломерате, 1.3.4. – класс агломерата, если указана проверка изоморфизма). Перечисление молекул в агломерате (0000001=2,3,4,5,) (1 – номер молекулы (7 символов), знак равенства, перечисление связанных молекул через запятую).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Общая статистика &amp;quot;.SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------&amp;quot;..После указания блока следует разметка таблицы (2 строки). Формат таблицы&lt;br /&gt; 0000001 0000002 000003.00 004.00000 0005.00000&lt;br /&gt;Пробел, размер агломерата (7 символов), пробел, общее число агломератов данной стехиометрии (7 символов), пробел, средняя концентрация агломератов данной стехиометрии (9 символов, 2 десятичной части), пробел, вероятность нахождения молекулы в агломерате данной стехиометрии (9 символов, 5 десятичной части), пробел, вероятность нахождения молекулы в агломерате данной стехиометрии, умноженная на число молекул в агломерате (10 символов, 5 десятичной части).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Общая статистика агломератов по классам (если указана проверка изоморфизма). Доля линейных (LINEAR=0.10000) и циклических (CYCLE=0.10000) агломератов, пропуск строки, доля неразветвленных (NOT BRANCHED=0.10000) и разветвленных (BRANCHED=0.10000) агломератов, пропуск строки, доля найденных циклов указанного размера (CYCLE_03=0.10000).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Пошаговое чтение исходных файлов, установка переменных.&lt;br /&gt;Поиск взаимодействий, удовлетворяющих указанным критериям.&lt;br /&gt;Анализ всех связей и указание связи двух молекул, если удовлетворяется условия хотя бы одного из указанных критериев.&lt;br /&gt;Добавление молекул в агломераты согласно полученной матрице связанности.&lt;br /&gt;Печать агломератов в файл, дополнение общей статистики.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать общей статистики в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Агломерация&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать маску траекторных файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать первый и последний шаги траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать искомые атомы.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать взаимодействия. Из выпадающего списка выбрать тип взаимодействия, изменить при его критерий (А) и нажать &amp;quot;Сохранить&amp;quot;. После завершения редактирования нажать &amp;quot;Добавить&amp;quot; – после этого взаимодействие появится в специальном окошке.. Для удаления взаимодействия необходимо выделить нужное взаимодействие в окошке и нажать &amp;quot;Удалить&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать максимальную глубину для проверки числа циклов в агломератах, файл лога и генерацию графика.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Для вариации геометрических критериев необходимо указать шаг изменения критериев и число шагов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message utf8="true">
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="266"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;envir&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that searchs environment for chosen molecule by geometric criterion.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_envir -i FILE -c X,Y,Z -o FILE [ -n NUMBER ] [ -r NUMBER ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-o FILE – output PDB file&lt;br /&gt;-n NUMBER – number of molecule for search. Default is 1&lt;br /&gt;-r NUMBER – radius of environment. Default is 6.0&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory file (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading of source file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Search for the environment.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the environment to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Environment&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size, A.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output PDB file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the number of molecule for search and the radius of environment.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;envir&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации PDB файла указанной молекулы с окружением указанного радиуса.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_envir -i ФАЙЛ -c X,Y,Z -o ФАЙЛ [ -n ЧИСЛО ] [ -r ЧИСЛО ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный файл с координатами&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый PDB файл с координатами&lt;br /&gt;-n ЧИСЛО – номер молекулы для поиска окружения. По умолчанию 1&lt;br /&gt;-r ЧИСЛО – радиус окружения, А. По умолчанию 6.0&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл траектории (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение исходного файла.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Поиск окружения.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать окружения в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Окружение&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать исходный файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый PDB файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать молекулу для поиска окружения и радиус окружения в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message utf8="true">
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="297"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;radf&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that calculates radial distribution function (RDF) or radial-angles distribution function (RADF).&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_radf -i MASK -s NUMBER,NUMBER -c X,Y,Z -at FORMAT -o FILE [ -r NUMBER,NUMBER ] [ -rs NUMBER ] [ -a NUMBER,NUMBER ] [ -as NUMBER ] [ -m ] [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i MASK – mask of trajectory files&lt;br /&gt;-s NUMBER,NUMBER – first and last trajectory steps&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-at FORMAT – numerical atom types between which the function is calculated. Format is &amp;quot;1-2&amp;quot; or &amp;quot;1,2,3-4,5,6&amp;quot; (automatically enable calculation of radial distribution function between centers of mass)&lt;br /&gt;-o FILE – output file&lt;br /&gt;-r NUMBER,NUMBER – radial criteria, A. Default is 2.0 and 15.0&lt;br /&gt;-rs NUMBER – radius change step, A. Default is 0.2&lt;br /&gt;-a NUMBER,NUMBER – angular criteria, deg. Default is 0.0 and 90.0&lt;br /&gt;-as NUMBER – angle change step, deg. This option will enable calculation of radial-angles distribution function&lt;br /&gt;-as – enable matrix output&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Output file (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Program name and version are shown in the title. For example, &amp;quot;radf ::: V.1.2.0&amp;quot;. Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The configuration block &amp;quot;CONFIGURATION ... END&amp;quot;. Print log (LOG=1), do not print messages to STDOUT (QUIET=1), matrix output (MATRIX=1), mask of trajectory files (MASK=mask), first (FIRST=1) and last (LAST=1) trajectory steps, sell size (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), mode (MODE=0) (0 – radial distribution function, 1 – radial distribution function between centers of mass, 2 – radial-angles distribution function), radial criteria (R_MIN=0.100) (R_MAX=0.100) (R_STEP=0.100), angular criteria for radial-angles distribution function (ANG_MIN=0.10) (ANG_MAX=0.10) (ANG_STEP=0.10), atom types (ATOM=1-2) or (ATOM=1,2,3-4,5,6). Blank line.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The results block «SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------». Table layout (2 rows) follows after specifying the block if matrix output disables.&lt;br /&gt;The table format for radial distribution function (matrix output disables)&lt;br /&gt; 0001.0000 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, segment volume (10 characters, 4 decimal part), space, number of molecules in this radius (9 characters), space, radial distribution function (9 characters, 6 decimal part).&lt;br /&gt;The table format for radial distribution function (matrix output enables)&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, radial distribution function (9 characters, 6 decimal part).&lt;br /&gt;The table format for radial-angles distribution function (matrix output disables)&lt;br /&gt; 0001.0000 000005.00 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, segment angle (9 characters, 2 decimal part), segment volume (10 characters, 4 decimal part), space, number of molecules in this segment (9 characters), space, radial-angles distribution function (9 characters, 6 decimal part).&lt;br /&gt;The table format for radial-angles distribution function (matrix output enables). Segment angle (9 characters, 2 decimal part) is shown in the title&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000 ...&lt;br /&gt;Space, sphere radius (9 characters, 4 decimal part), space, radial-angles distribution function (9 characters, 6 decimal part) separated by spaces.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;End of the table&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Step by step reading of source files, settings values of variables.&lt;br /&gt;Calculating of the number of pairs of molecules in various relative configurations.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the result to the file.&lt;br /&gt;Radial distribution function calculated by:&lt;br /&gt;RDF(r) = (1 / norm) * sum(d(r_n-r), n),&lt;br /&gt;norm(r) = (4*PI*r^2*dr) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;where d(r_n-r) is the delta function, r is a shpere radius, n is a number of molecule, dr is the radius change step, ro is the number of molecules per volume unit, N is the number of molecules, N_step is a number of trajectory step.&lt;br /&gt;Radial-angles distribution function calculated by:&lt;br /&gt;RADF(r, fi) = (1 / norm) * sum(sum(d(r_n-r)*d(fi_n-fi), n), n),&lt;br /&gt;norm(r, fi) = (4*PI*r^2*sin(fi)*dr*dfi) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;where d(r_n-r) and d(fi_n-fi) are the delta functions, r is a shpere radius, fi is a segment angle, n is a number of molecule, dr is the radius change step, dfi is the angle change step, ro is the number of molecules per volume unit, N is the number of molecules, N_step is a number of trajectory step.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;RADF&amp;quot;. Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the mask of trajectory files.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the first and the last trajectory steps.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size, A.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set needed atoms.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set radial criteria. Set angular criteria if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the matrix output, the log file and the graph generate if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;radf&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для расчета функций радиального (ФРР) и радиально-углового распределения (ФРУР).&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_radf -i МАСКА -s ЧИСЛО,ЧИСЛО -c X,Y,Z -at ФОРМАТ -o ФАЙЛ [ -r ЧИСЛО,ЧИСЛО ] [ -rs ЧИСЛО ] [ -a ЧИСЛО,ЧИСЛО ] [ -as ЧИСЛО ] [ -m ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i МАСКА – маска снимков траектории&lt;br /&gt;-s ЧИСЛО,ЧИСЛО – первый и последний шаги траектории&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-at ФОРМАТ – численные типы атомов между которыми строится функция. Формат &amp;quot;1-2&amp;quot; или &amp;quot;1,2,3,-4,5,6&amp;quot; (автоматически включит расчет функции радиального распределения между центрами масс).&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый файл&lt;br /&gt;-r ЧИСЛО,ЧИСЛО – минимальный и максимальный радиус, А. По умолчанию 2.0 и 15.0&lt;br /&gt;-rs ЧИСЛО – шаг изменения радиуса, А. По умолчанию 0.2&lt;br /&gt;-a ЧИСЛО,ЧИСЛО – минимальный и максимальный угол, град. По умолчанию 0.0 и 90.0&lt;br /&gt;-as ЧИСЛО – шаг изменения угла, град. Эта опция включит расчет функции радиально-углового распределения&lt;br /&gt;-m – печать в виде матрицы&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Генерируемый файл (*.dat)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;В заголовке указывается название программы и ее версия, например &amp;quot;radf ::: V.1.2.0&amp;quot;. Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок конфигурации &amp;quot;CONFIGURATION … END&amp;quot;. Печать лога (LOG=1), не выводить сообщения в STDOUT (QUIET=1), матричный вывод (MATRIX=1), файлов (MASK=mask), первый (FIRST=1) и последний (LAST=1) шаги траектории, размер ячейки (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), тип расчета (MODE=0) (0 – для функции радиального распределения, 1 – для функции радиального распределения для центров масс, 2 – для функции радиально-углового распределения), радиальные критерии (R_MIN=0.100) (R_MAX=0.100) (R_STEP=0.100), угловые критерии для функции радиально-углового распределения (ANG_MIN=0.10) (ANG_MAX=0.10) (ANG_STEP=0.10), типы атомов (ATOM=1-2) или (ATOM=1,2,3-4,5,6). Пустая строка.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Блок результатов &amp;quot;SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------&amp;quot;. После указания блока, если отключен матричный вывод, следует разметка таблицы (2 строки).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиального распределения (матричный вывод отключен)&lt;br /&gt; 0001.0000 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, объем сегмента (10 символов, 4 десятичной части), пробел, число молекул в данном сегменте (9 символов), функция радиального распределения (9 символов, 6 десятичной части).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиального распределения (матричный вывод включен)&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, функция радиального распределения (9 символов, 6 десятичной части).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиально-углового распределения (матричный вывод отключен)&lt;br /&gt; 0001.0000 000005.00 2.0000e-01 000000003 04.000000&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, угол (9 символов, 2 десятичной части), пробел, объем сегмента (10 символов, 4 десятичной части), пробел, число молекул в данном сегменте (9 символов), функция радиально-углового распределения (9 символов, 6 десятичной части).&lt;br /&gt;Формат таблицы для функций радиально-углового распределения (матричный вывод включен). В заголовке указывается угол (9 символов, 2 десятичной части)&lt;br /&gt; 0001.0000 04.000000 …&lt;br /&gt;Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, функция радиально-углового распределения (9 символов, 6 десятичной части) через пробелы, соответствующие данному углу.&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Конец таблицы.&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложенияn&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Пошаговое чтение исходных файлов. Установка переменных.&lt;br /&gt;Расчет количества пар молекул, находящихся в различных взаимных конфигурациях.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать результата в файл.&lt;br /&gt;Функция радиального распределения рассчитывается по формуле:&lt;br /&gt;RDF(r) = (1 / norm) * sum(d(r_n-r), n),&lt;br /&gt;norm(r) = (4*PI*r^2*dr) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;где d(r_n-r) – дельта-функция, r – радиус сферы, n – номер молекулы, dr – шаг изменения радиуса, ro – число молекул в единице объема, N – число молекул, N_step – число шагов траектории.&lt;br /&gt;Функция радиально-углового распределения рассчитывается по формуле:&lt;br /&gt;RADF(r, fi) = (1 / norm) * sum(sum(d(r_n-r)*d(fi_n-fi), n), n),&lt;br /&gt;norm(r, fi) = (4*PI*r^2*sin(fi)*dr*dfi) * ro * N * N_step,&lt;br /&gt;где d(r_n-r) и d(fi_n-fi) – дельта-функции, r – радиус сферы, fi – угол, n – номер молекулы, dr – шаг изменения радиуса, dfi – шаг изменения угла, ro – число молекул в единице объема, N – число молекул, N_step – число шагов траектории.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;ФРУР&amp;quot;. Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать маску траекторных файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать первый и последний шаги траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать искомые атомы.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать радиальные параметры функции в А. При необходимости указать угловые параметры функции в градусах.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать печать в виде матрицы, файл лога и генерацию графика.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message utf8="true">
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="337"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;agl&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that creates PDB file with chosen agglomerate.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_agl -a FILE -i FILE -c X,Y,Z -o FILE [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-a FILE – input file with agglomerate&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – cell size, A&lt;br /&gt;-o FILE – output PDB file&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Agglomerate file (*.agl)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Agglomerate title (AGL=2=1.3.4.) (1 – number of molecules in the agglomerate, 1.3.4. – agglomerate class, if verification of isomorphism is specified).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;The enumeration of molecules in the agglomerate (0000001=2,3,4,5,) (1 – number of molecule (7 characters), equal sign, the enumeration of connected molecules separated by commas).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory file (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading of source file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Search for the best configuration.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the result to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select Menu -&amp;gt; File creator -&amp;gt; Agglomerate file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the file generated by statgen. Push &amp;quot;Select&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Select the trajectory file from the drop down list. Select the agglomerate.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output file. Create file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Generate PDB&amp;quot;. Select &amp;quot;From agglomerate&amp;quot; from the drop down list.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the agglomerate file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the cell size, A.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output PDB file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;agl&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации PDB файлов с агломератами.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_agl -a ФАЙЛ -i ФАЙЛ -c X,Y,Z -o ФАЙЛ [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-a ФАЙЛ – исходный файл с агломератом&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный файл с координатами&lt;br /&gt;-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый PDB файл с координатами&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл с агломератом (*.agl)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ul style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Заголовок агломерата (AGL=2=1.3.4.) (1 – число молекул в агломерате, 1.3.4. – класс агломерата, если указана проверка изоморфизма).&lt;/li&gt;
&lt;li style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перечисление молекул в агломерате (0000001=2,3,4,5,) (1 – номер молекулы (7 символов), знак равенства, перечисление связанных молекул через запятую).&lt;/li&gt;&lt;/ul&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл траектории (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение исходных файлов.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Поиск оптимальной конфигурации.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать результата в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Меню -&amp;gt; Создание файлов -&amp;gt; Файл с агломератом.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать файл, сгенерированный приложением statgen. Нажать &amp;quot;Выбор&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Выбрать траекторный снимок в выпадающем списке. Выбрать агломерат.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать выходной файл. Создать файл с агломератом.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;5. Перейти во вкладку &amp;quot;Создать PDB&amp;quot;. Из выпадающего списка выбрать &amp;quot;Из агломерата&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать файл траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать сгенерированный файл с агломератом.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать размер ячейки в А.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый PDB файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="374"/>
<source>agl</source>
<translation>agl</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="376"/>
<source>Help about trj2pdb</source>
<translation>Справка по trj2pdb</translation>
</message>
<message utf8="true">
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="378"/>
<source>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;trj2pdb&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Program that creates PDB file from trajetory snapshot.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Usage&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_trj2pdb -i FILE -o FILE [ -l FILE ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Parametrs&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i FILE – input trajectory file&lt;br /&gt;-o FILE – output PDB file&lt;br /&gt;-l FILE – print log to specified file&lt;br /&gt;-q – do not print messages to STDOUT&lt;br /&gt;-h – show this help and exit&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;File formats&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Trajectory file (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Operation of the application&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading titles of source files, setting values of initial variables.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Reading of source file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Print the result to the file.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Working with GUI&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Go to the tab &amp;quot;Generate PDB&amp;quot;. Select &amp;quot;From trajectory snapshot&amp;quot; from the drop down list.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the work directory.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the input trajectory file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the output PDB file.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Set the log file if this needed.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Run application.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</source>
<translation>&lt;!DOCTYPE HTML PUBLIC &quot;-//W3C//DTD HTML 4.0//EN&quot; &quot;http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd&quot;&gt;
&lt;html&gt;&lt;head&gt;&lt;meta name=&quot;qrichtext&quot; content=&quot;1&quot; /&gt;&lt;style type=&quot;text/css&quot;&gt;
p, li { white-space: pre-wrap; }
&lt;/style&gt;&lt;/head&gt;&lt;body style=&quot; font-family:&apos;Liberation Serif&apos;; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;&quot;&gt;
&lt;p align=&quot;center&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;span style=&quot; font-weight:600;&quot;&gt;trj2pdb&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt;Программа для генерации PDB файла из исходных траекторных файлов.&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Использование&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;mm_trj2pdb -i ФАЙЛ -o ФАЙЛ [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Параметры&lt;/span&gt;&lt;br /&gt;-i ФАЙЛ – исходный файл с координатами&lt;br /&gt;-o ФАЙЛ – генерируемый PDB файл с координатами&lt;br /&gt;-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл&lt;br /&gt;-q – не выводить сообщения в STDOUT&lt;br /&gt;-h – показать эту справку и выйти&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Форматы файлов&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt; &lt;span style=&quot; font-style:italic;&quot;&gt;Файл траектории (*.pdb)&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;a href=&quot;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&quot;&gt;&lt;span style=&quot; text-decoration: underline; color:#0000ff;&quot;&gt;http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html&lt;/span&gt;&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа приложения&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Чтение исходного файла.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Печать в файл.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;
&lt;p align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;&lt;br /&gt; &lt;span style=&quot; text-decoration: underline;&quot;&gt;Работа с графическим интерфейсом&lt;/span&gt;&lt;/p&gt;
&lt;ol style=&quot;margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;&quot;&gt;&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Перейти во вкладку &amp;quot;Создать PDB&amp;quot;. Из выпадающего списка выбрать &amp;quot;Из снимка траектории&amp;quot;.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать рабочую директорию.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать файл траектории.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Указать генерируемый PDB файл.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;При необходимости указать файл лога.&lt;/li&gt;
&lt;li align=&quot;justify&quot; style=&quot; margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;&quot;&gt;Запустить приложение.&lt;/li&gt;&lt;/ol&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="403"/>
<source>trj2pdb</source>
<translation>trj2pdb</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="405"/>
<source>Save help to html</source>
<translation>Сохранить справку в html</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="407"/>
<source>Save html</source>
<translation>Сохранить html</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="409"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_helpwindow.h" line="411"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/helpwindow.cpp" line="36"/>
<source>Save file as</source>
<translation>Сохранить файл как</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/helpwindow.cpp" line="38"/>
<source>html files (*.html);;All files (*.*)</source>
<translation>html файлы (*.html);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<source>&apos;statgen&apos; output files (*.dat);;All files (*.*)</source>
<translation type="obsolete">Файлы &apos;statgen&apos; (*.dat);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>MainWindow</name>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="27"/>
<source>Ready</source>
<translation>Готов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="247"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="301"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="344"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="387"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="430"/>
<source>Select work directory</source>
<translation>Выбор рабочей директории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="257"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="354"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="440"/>
<source>Select trajectory file</source>
<translation>Выбор файла траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="259"/>
<source>All files (*.*)</source>
<translation>Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="268"/>
<source>Select atom types file</source>
<translation>Выбор файла типов атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="270"/>
<source>Atom types files (*.types);;All files (*.*)</source>
<translation>Файл типов атомов (*.types);;Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="279"/>
<source>Save files as</source>
<translation>Сохранить файл как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="281"/>
<source>Mask of trajectory files</source>
<translation>Маска файлов траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="290"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="333"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="376"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="419"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="473"/>
<source>Save log file as...</source>
<translation>Сохранить лог как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="292"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="335"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="378"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="421"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="475"/>
<source>Log files (*.log)</source>
<translation>Лог (*.log)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="311"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="397"/>
<source>Select trajectory files</source>
<translation>Выбор файла траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="313"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="356"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="399"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="442"/>
<source>Trajectory files (*.*[0-9])</source>
<translation>Файлы траектории (*.*[0-9])</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="322"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="408"/>
<source>Save output file as...</source>
<translation>Сохранить файл как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="324"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="410"/>
<source>Output files (*.dat)</source>
<translation>Выходной файл (*.dat)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="365"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="462"/>
<source>Save PDB file as...</source>
<translation>Сохранить PDB как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="367"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="464"/>
<source>PDB files (*.pdb)</source>
<translation>PDB файл (*.pdb)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="451"/>
<source>Select agglomerate file</source>
<translation>Выбор файла с агломератом</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="453"/>
<source>Agglomerate files (*.agl);;All files (*.*)</source>
<translation>Файл с агломератом (*.agl);Все файлы (*.*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="622"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="623"/>
<source>Processing &apos;trj&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;trj&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="633"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="718"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="766"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="836"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="904"/>
<source>Done</source>
<translation>Готово</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="690"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="691"/>
<source>Processing &apos;statgen&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;statgen&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="756"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="757"/>
<source>Processing &apos;envir&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;envir&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="822"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="823"/>
<source>Processing &apos;radf&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;radf&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="879"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="880"/>
<source>Processing &apos;agl&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;agl&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="884"/>
<location filename="../../src/mainwindow.cpp" line="885"/>
<source>Processing &apos;trj2pdb&apos;...</source>
<translation>Выполняется &apos;trj2pdb&apos;...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2192"/>
<source>Mathematical Molecular Mechanics</source>
<translation>Mathematical Molecular Mechanics</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2256"/>
<source>Generate trajectory</source>
<translation>Создать траекторию</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2206"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2257"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2365"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2415"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2540"/>
<source>Work directory</source>
<translation>Рабочая директория</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2210"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2215"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2233"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2238"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2247"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2261"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2266"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2335"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2344"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2369"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2374"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2392"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2405"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2419"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2424"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2451"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2518"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2544"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2549"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2554"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2572"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2577"/>
<source>Browse</source>
<translation>Обзор</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2211"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2370"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2545"/>
<source>Input file</source>
<translation>Входной файл</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2216"/>
<source>Type of trajectory</source>
<translation>Тип траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2219"/>
<source>GROMACS text</source>
<translation>GROMACS</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2220"/>
<source>PUMA</source>
<translation>PUMA</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2225"/>
<source>Number of steps</source>
<translation>Число шагов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2229"/>
<source>Atom type file</source>
<translation>Файл типов атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2234"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2236"/>
<source>Mask of output files</source>
<translation>Маска файлов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2239"/>
<source>Total atom types</source>
<translation>Всего типов атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2243"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2340"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2401"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2514"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2573"/>
<source>Log</source>
<translation>Лог</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2251"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2359"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2409"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2522"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2581"/>
<source>Clear</source>
<translation>Очистить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2255"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2363"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2413"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2530"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2585"/>
<source>Start</source>
<translation>Старт</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2364"/>
<source>Agglomeration</source>
<translation>Агломерация</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2262"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2264"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2420"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2422"/>
<source>Mask of input files</source>
<translation>Маска файлов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2202"/>
<source>Ctrl+P</source>
<translation>Ctrl+P</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2208"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2259"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2367"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2417"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2542"/>
<source>Path to work directory</source>
<translation>Путь к рабочей директории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2213"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2372"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2547"/>
<source>Path to input file</source>
<translation>Путь ко входному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2223"/>
<source>Input trajectory type</source>
<translation>Тип входной траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2227"/>
<source>Number of steps in trajectory</source>
<translation>Число шагов в траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2231"/>
<source>Path to file with atom types</source>
<translation>Путь к файлу с типами атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2241"/>
<source>Maximum number of atom types</source>
<translation>Максимальное число типов атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2245"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2342"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2403"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2516"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2575"/>
<source>Path to log file</source>
<translation>Путь к логу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2249"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2357"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2407"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2520"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2579"/>
<source>Clear window</source>
<translation>Очистить окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2253"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2361"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2411"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2528"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2583"/>
<source>Start application</source>
<translation>Запустить приложение</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2267"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2425"/>
<source>Steps</source>
<translation>Шаги</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2268"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2426"/>
<source>first</source>
<translation>первый</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2270"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2428"/>
<source>First trajectory step</source>
<translation>Первый шаг траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2272"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2430"/>
<source>last</source>
<translation>последний</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2274"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2432"/>
<source>Last trajectory step</source>
<translation>Последний шаг траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2276"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2375"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2434"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2555"/>
<source>Cell, A</source>
<translation>Ячейка, А</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2277"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2376"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2435"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2556"/>
<source>X</source>
<translation>X</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2279"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2378"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2437"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2558"/>
<source>Cell size, X</source>
<translation>Размер ячейки, X</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2281"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2380"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2439"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2560"/>
<source>Y</source>
<translation>Y</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2283"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2382"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2441"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2562"/>
<source>Cell size, Y</source>
<translation>Размер ячейки, Y</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2285"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2384"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2443"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2564"/>
<source>Z</source>
<translation>Z</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2287"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2386"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2445"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2566"/>
<source>Cell size, Z</source>
<translation>Размер ячейки, Z</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2289"/>
<source>atom 0</source>
<translation>атом 0</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2291"/>
<source>atom0 type</source>
<translation>тип 1го атома</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2293"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2460"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2475"/>
<source>atom 1</source>
<translation>атом 1</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2295"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2462"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2473"/>
<source>atom1 type</source>
<translation>тип 2го атома</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2297"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2467"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2479"/>
<source>atom 2</source>
<translation>атом 2</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2299"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2465"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2477"/>
<source>atom2 type</source>
<translation>тип 3го атома</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2301"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2471"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2483"/>
<source>atom 3</source>
<translation>атом 3</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2303"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2469"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2481"/>
<source>atom3 type</source>
<translation>тип 4го атома</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2305"/>
<source>Interaction</source>
<translation>Взаимодействие</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2308"/>
<source>0-0</source>
<translation>0-0</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2311"/>
<source>Type of interaction</source>
<translation>Тип взаимодействия</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2314"/>
<source>Criterion</source>
<translation>Критерий</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2317"/>
<source>Save this criterion</source>
<translation>Сохранить данный критерий</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2319"/>
<source>Save</source>
<translation>Сохранить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2321"/>
<source>Add this interaction</source>
<translation>Добавить данное взаимодействие</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2323"/>
<source>Add</source>
<translation>Добавить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2325"/>
<source>Added interactions</source>
<translation>Добавленные взаимодействия</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2328"/>
<source>Remove selected interaction</source>
<translation>Удалить выбранное взаимодействие</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2330"/>
<source>Remove</source>
<translation>Удалить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2331"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2388"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2447"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2568"/>
<source>Output file</source>
<translation>Выходной файл</translation>
</message>
<message>
<source>Path to ouput file</source>
<translation type="obsolete">Путь к выходному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2336"/>
<source>Depth of search</source>
<translation>Глубина поиска</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2338"/>
<source>Search depth of related graphs</source>
<translation>Глубина поиска родственных графов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2345"/>
<source>Analysis</source>
<translation>Анализ</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2347"/>
<source>Step of analysis</source>
<translation>Шаг анализа</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2350"/>
<source>Number of steps of analysis</source>
<translation>Число шагов в анализе</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2353"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2524"/>
<source>Show graph</source>
<translation>Показать график</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2355"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2526"/>
<source>Graph</source>
<translation>График</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2333"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2390"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2449"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2570"/>
<source>Path to output file</source>
<translation>Путь к выходному файлу</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2395"/>
<source>Number of selected molecule</source>
<translation>Номер выбранной молекулы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2399"/>
<source>Radius of environment</source>
<translation>Радиус окружения</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2414"/>
<source>Environment</source>
<translation>Окружение</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2393"/>
<source>Molecule</source>
<translation>Молекула</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2397"/>
<source>Radius</source>
<translation>Радиус</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2531"/>
<source>RADF</source>
<translation>ФРУР</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2454"/>
<source>One atom function</source>
<translation>Одноатомная функция</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2455"/>
<source>Three atom function</source>
<translation>Трехатомная функция</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2458"/>
<source>Type of function</source>
<translation>Тип функции</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2484"/>
<source>R, A</source>
<translation>R, A</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2485"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2498"/>
<source>min</source>
<translation>min</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2487"/>
<source>Minimal radius</source>
<translation>Минимальный радиус</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2489"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2502"/>
<source>max</source>
<translation>max</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2491"/>
<source>Maximal radius</source>
<translation>Максимальный радиус</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2493"/>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2506"/>
<source>step</source>
<translation>шаг</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2495"/>
<source>Radius step</source>
<translation>Шаг</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2497"/>
<source>Angle, deg</source>
<translation>Угол, град</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2500"/>
<source>Minimal angle</source>
<translation>Минимальный угол</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2504"/>
<source>Maximal angle</source>
<translation>Максимальный угол</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2508"/>
<source>Angle step</source>
<translation>Шаг</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2511"/>
<source>Matrix output</source>
<translation>Результат в виде матрицы</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2513"/>
<source>Matrix</source>
<translation>Матрица</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2538"/>
<source>Input file type</source>
<translation>Тип входного файла</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2552"/>
<source>Path to file with agglomerate</source>
<translation>Путь к файлу с агломератом</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2586"/>
<source>Generate PDB</source>
<translation>Создать PDB</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2534"/>
<source>From agglomerate</source>
<translation>Из агломерата</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2535"/>
<source>From trajectory snapshot</source>
<translation>Из снимка траектории</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2550"/>
<source>File with agglomerate</source>
<translation>Файл с агломератом</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2587"/>
<source>Menu</source>
<translation>Меню</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2588"/>
<source>File &amp;creator</source>
<translation>&amp;Создание файлов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2589"/>
<source>&amp;Tools</source>
<translation>&amp;Утилиты</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2590"/>
<source>Help</source>
<translation>Помощь</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2193"/>
<source>&amp;Quit</source>
<translation>&amp;Выход</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2195"/>
<source>Quit</source>
<translation>Выход</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2197"/>
<source>Ctrl+Q</source>
<translation>Ctrl+Q</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2204"/>
<source>&amp;Help</source>
<translation>&amp;Помощь</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2205"/>
<source>F1</source>
<translation>F1</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2198"/>
<source>About</source>
<translation>О программе</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2199"/>
<source>Atom &amp;types file</source>
<translation>Файл типов &amp;атомов</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2200"/>
<source>&amp;Agglomerate file</source>
<translation>Файл с &amp;агломератом</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2201"/>
<source>&amp;Settings</source>
<translation>&amp;Настройки</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_mainwindow.h" line="2203"/>
<source>agl_all</source>
<translation>agl_all</translation>
</message>
<message>
<source>statgen_all</source>
<translation type="obsolete">statgen_all</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>SettingsWindow</name>
<message>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="190"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="201"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="212"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="223"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="234"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="245"/>
<source>Select component</source>
<translation>Выбор компонента</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="192"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="203"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="214"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="225"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="236"/>
<location filename="../../src/settingswindow.cpp" line="247"/>
<source>All files (*)</source>
<translation>Все файлы (*)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="315"/>
<source>Settings</source>
<translation>Настройки</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="316"/>
<source>mm_trj</source>
<translation>mm_trj</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="318"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="323"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="328"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="333"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="338"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="343"/>
<source>Path to component</source>
<translation>Путь к компоненту</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="320"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="325"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="330"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="335"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="340"/>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="345"/>
<source>Browse</source>
<translation>Обзор</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="321"/>
<source>mm_statgen</source>
<translation>mm_statgen</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="326"/>
<source>mm_envir</source>
<translation>mm_envir</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="331"/>
<source>mm_radf</source>
<translation>mm_radf</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="336"/>
<source>mm_trj2pdb</source>
<translation>mm_trj2pdb</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="341"/>
<source>mm_agl</source>
<translation>mm_agl</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="348"/>
<source>English</source>
<translation>English</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="349"/>
<source>Russian</source>
<translation>Russian</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="352"/>
<source>Application language</source>
<translation>Язык приложения</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="354"/>
<source>You need to restart application</source>
<translation>You need to restart application</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="356"/>
<source>Save settings</source>
<translation>Сохранить настройки</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="358"/>
<source>Save</source>
<translation>Сохранить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="360"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_settingswindow.h" line="362"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
</context>
<context>
<name>StatgenGraphWindow</name>
<message>
<location filename="../../src/statgengraphwindow.cpp" line="54"/>
<source>N</source>
<translation>N</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/statgengraphwindow.cpp" line="55"/>
<source>p</source>
<translation>p</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/statgengraphwindow.cpp" line="72"/>
<source>r</source>
<translation>r</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/statgengraphwindow.cpp" line="73"/>
<source>g</source>
<translation>g</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/statgengraphwindow.cpp" line="147"/>
<source>Save image as...</source>
<translation>Сохранить изображение как...</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../src/statgengraphwindow.cpp" line="149"/>
<source>JPEG file (*.jpeg);;Portable Network Graphics file (*.png);;Bitmap file (*.bmp)</source>
<translation>JPEG (*.jpeg);;Portable Network Graphics (*.png);;Bitmap (*.bmp)</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_statgengraphwindow.h" line="79"/>
<source>Graph</source>
<translation>График</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_statgengraphwindow.h" line="81"/>
<source>Save graph</source>
<translation>Сохранить график</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_statgengraphwindow.h" line="83"/>
<source>Save</source>
<translation>Сохранить</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_statgengraphwindow.h" line="85"/>
<source>Close window</source>
<translation>Закрыть окно</translation>
</message>
<message>
<location filename="../../build/src/ui_statgengraphwindow.h" line="87"/>
<source>Close</source>
<translation>Закрыть</translation>
</message>
</context>
</TS>
Reference in New Issue View Git Blame Copy Permalink