mirror of
https://github.com/arcan1s/moldyn.git
synced 2025-09-10 17:49:57 +00:00
Release 1.1.0
+ added help window + added help docs + small bug fixes
This commit is contained in:
arcan1s
27
mathmech/docs/rus/help_radf.html
Normal file
27
mathmech/docs/rus/help_radf.html
Normal file
@ -0,0 +1,27 @@
|
||||
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/strict.dtd">
|
||||
<html><head><meta name="qrichtext" content="1" /><style type="text/css">
|
||||
p, li { white-space: pre-wrap; }
|
||||
</style></head><body style=" font-family:'Liberation Serif'; font-size:10pt; font-weight:400; font-style:normal;">
|
||||
<p align="center" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"><span style=" font-weight:600;">radf</span></p>
|
||||
<p align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"><br />Программа для расчета функций радиального (ФРР) и радиально-углового распределения (ФРУР).</p>
|
||||
<p align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"><br /> <span style=" text-decoration: underline;">Использование</span><br />mm_radf -i МАСКА -s ЧИСЛО,ЧИСЛО -c X,Y,Z -at ФОРМАТ -o ФАЙЛ [ -r ЧИСЛО,ЧИСЛО ] [ -rs ЧИСЛО ] [ -a ЧИСЛО,ЧИСЛО ] [ -as ЧИСЛО ] [ -m ] [ -l ФАЙЛ ] [ -q ] [ -h ]<br /> <span style=" text-decoration: underline;">Параметры</span><br />-i МАСКА – маска снимков траектории<br />-s ЧИСЛО,ЧИСЛО – первый и последний шаги траектории<br />-c X,Y,Z – размер элементарной ячейки, А<br />-at ФОРМАТ – численные типы атомов между которыми строится функция. Формат "1-2" или "1,2,3,-4,5,6" (автоматически включит расчет функции радиального распределения между центрами масс).<br />-o ФАЙЛ – генерируемый файл<br />-r ЧИСЛО,ЧИСЛО – минимальный и максимальный радиус, А. По умолчанию 2.0 и 15.0<br />-rs ЧИСЛО – шаг изменения радиуса, А. По умолчанию 0.2<br />-a ЧИСЛО,ЧИСЛО – минимальный и максимальный угол, град. По умолчанию 0.0 и 90.0<br />-as ЧИСЛО – шаг изменения угла, град. Эта опция включит расчет функции радиально-углового распределения<br />-m – печать в виде матрицы<br />-l ФАЙЛ – запись лога в указанный файл<br />-q – не выводить сообщения в STDOUT<br />-h – показать эту справку и выйти</p>
|
||||
<p align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"><br /> <span style=" text-decoration: underline;">Форматы файлов</span></p>
|
||||
<p align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"> <span style=" font-style:italic;">Генерируемый файл (*.dat)</span></p>
|
||||
<ul style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;"><li align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">В заголовке указывается название программы и ее версия, например "radf ::: V.1.1.0". Пустая строка.</li>
|
||||
<li style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Блок конфигурации "CONFIGURATION … END". Печать лога (LOG=1), не выводить сообщения в STDOUT (QUIET=1), матричный вывод (MATRIX=1), файлов (MASK=mask), первый (FIRST=1) и последний (LAST=1) шаги траектории, размер ячейки (CELL=1.0000,2.0000,3.0000), тип расчета (MODE=0) (0 – для функции радиального распределения, 1 – для функции радиального распределения для центров масс, 2 – для функции радиально-углового распределения), радиальные критерии (R_MIN=0.100) (R_MAX=0.100) (R_STEP=0.100), угловые критерии для функции радиально-углового распределения (ANG_MIN=0.10) (ANG_MAX=0.10) (ANG_STEP=0.10), типы атомов (ATOM=1-2) или (ATOM=1,2,3-4,5,6). Пустая строка.</li>
|
||||
<li style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Блок результатов "SUMMARY STATISTIC … ------------------------------------------------". После указания блока, если отключен матричный вывод, следует разметка таблицы (2 строки).<br />Формат таблицы для функций радиального распределения (матричный вывод отключен)<br /> 0001.0000 2.0000e-01 000000003 04.000000<br />Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, объем сегмента (10 символов, 4 десятичной части), пробел, число молекул в данном сегменте (9 символов), функция радиального распределения (9 символов, 6 десятичной части).<br />Формат таблицы для функций радиального распределения (матричный вывод включен)<br /> 0001.0000 04.000000<br />Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, функция радиального распределения (9 символов, 6 десятичной части).<br />Формат таблицы для функций радиально-углового распределения (матричный вывод отключен)<br /> 0001.0000 000005.00 2.0000e-01 000000003 04.000000<br />Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, угол (9 символов, 2 десятичной части), пробел, объем сегмента (10 символов, 4 десятичной части), пробел, число молекул в данном сегменте (9 символов), функция радиально-углового распределения (9 символов, 6 десятичной части).<br />Формат таблицы для функций радиально-углового распределения (матричный вывод включен). В заголовке указывается угол (9 символов, 2 десятичной части)<br /> 0001.0000 04.000000 …<br />Пробел, радиус сферы (9 символов, 4 десятичной части), пробел, функция радиально-углового распределения (9 символов, 6 десятичной части) через пробелы, соответствующие данному углу.</li>
|
||||
<li style=" margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Конец таблицы.</li></ul>
|
||||
<p align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"><br /> <span style=" text-decoration: underline;">Работа приложенияn</span></p>
|
||||
<ol style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;"><li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Чтение заголовков исходных файлов, установка начальных переменных.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Пошаговое чтение исходных файлов. Установка переменных.<br />Расчет количества пар молекул, находящихся в различных взаимных конфигурациях.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Печать результата в файл.<br />Функция радиального распределения рассчитывается по формуле:<br />RDF(r) = (1 / norm) * sum(d(r_n-r), n),<br />norm(r) = (4*PI*r^2*dr) * ro * N * N_step,<br />где d(r_n-r) – дельта-функция, r – радиус сферы, n – номер молекулы, dr – шаг изменения радиуса, ro – число молекул в единице объема, N – число молекул, N_step – число шагов траектории.<br />Функция радиально-углового распределения рассчитывается по формуле:<br />RADF(r, fi) = (1 / norm) * sum(sum(d(r_n-r)*d(fi_n-fi), n), n),<br />norm(r, fi) = (4*PI*r^2*sin(fi)*dr*dfi) * ro * N * N_step,<br />где d(r_n-r) и d(fi_n-fi) – дельта-функции, r – радиус сферы, fi – угол, n – номер молекулы, dr – шаг изменения радиуса, dfi – шаг изменения угла, ro – число молекул в единице объема, N – число молекул, N_step – число шагов траектории.</li></ol>
|
||||
<p align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;"><br /> <span style=" text-decoration: underline;">Работа с графическим интерфейсом</span></p>
|
||||
<ol style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; margin-right: 0px; -qt-list-indent: 1;"><li align="justify" style=" margin-top:12px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Перейти во вкладку "ФРУР". Указать рабочую директорию.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Указать маску траекторных файлов.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Указать первый и последний шаги траектории.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Указать размер ячейки в А.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Указать генерируемый файл.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Указать искомые атомы.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Указать радиальные параметры функции в А. При необходимости указать угловые параметры функции в градусах.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:0px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">При необходимости указать печать в виде матрицы, файл лога и генерацию графика.</li>
|
||||
<li align="justify" style=" margin-top:0px; margin-bottom:12px; margin-left:0px; margin-right:0px; -qt-block-indent:0; text-indent:0px;">Запустить приложение.</li></ol></body></html>
|
||||
Reference in New Issue
Block a user